Crayon Shin-chan sigue las disparatadas travesuras y aventuras de Shinnosuke "Shin" Nohara, de cinco años, y sus padres, vecinos y amigos. La serie se ambienta en Kasukabe, prefectura de Saitama, Japón. Muchos de los chistes de la serie se deben al uso ocasionalmente extraño, antinatural e inapropiado del lenguaje por parte de Shin-chan, así como a su comportamiento inapropiado. Un chiste típico es cuando Shin-chan confunde a sus padres al usar la frase equivocada para la ocasión; por ejemplo, diciendo "¡Bienvenidos de nuevo!" en lugar de "¡He vuelto!" al llegar a casa. Al principio de la serie, la serie se basaba principalmente en la historia del manga original. A medida que avanzaba, cada vez más episodios se convertían en originales del anime.